O Desafio Final do Secret Story - Casa dos Segredos em Portugal estreou a 6 de Janeiro de 2013 e terminou no dia 28 de Janeiro de 2013. Foi transmitido na TVI e produzido pela Endemol Portugal.

A Casa e as Regras

• A Casa dos Segredos localiza-se na Venda do Pinheiro, mais especificamente na Asseiceira Grande.
• A Casa apresenta a mesma decoração da 3ª edição, com algumas novidades como novos objetos e um novo telefone rosa localizado na sala.
• Algumas das decorações são: uma caixa a dizer explosivos no jardim. Uma paragem de autocarro também no jardim. Uma mão e uma chave na mesa da sala. Um código de barras no quarto azul (com a data de inicio da 2ª e 3ª edição). Um mapa astral do signo gémeos no quarto rosa. 5 relógios com a hora 12:00 na parede do contador. O contador marca o número 104107 (dias da duração da 2ª e 3ª edição, respetivamente). À porta do confessionário podemos ver o número 211.
• O vencedor recebe 10000€ e ainda pode receber prémios exclusivos como viagens e o acesso à final.
• Os concorrentes não apresentam uma conta com dinheiro que ganham com missões secretas como nas antigas edições, no Desafio Final têm um quadro com bolas verdes (quando a missão é bem sucedida) e bolas vermelhas (quando a missão falha). As bolas verdes podem tornar-se em recompensas monetárias e as bolas vermelhas em penalizações.
• Vários prémios foram atribuidos durante esta edição, como viagens, cruzeiros, visitas a spas e cheques para gastar em compras.